Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB7BQ96AH8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB7BQ96AH8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms