Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TTC17Q96AE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TTC17Q96AE7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC17Q96AE7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 569.2 ms