Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKL1Q969V6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms