Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHMTQ93088 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHMTQ93088 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms