Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRF1Q92994 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRF1Q92994 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRF1Q92994 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms