Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCTD4Q8WVF5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCTD4Q8WVF5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms