Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC12Q8WUD4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms