Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG1Q8WTW3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COG1Q8WTW3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms