Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
RB1CC1Q8TDY2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC43.22■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1Q8TDY2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC43.16■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
RB1CC1Q8TDY2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms