Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCD1

C18orf32, UPF0729 protein C18orf32, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf32Q8TCD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf32Q8TCD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf32Q8TCD1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf32Q8TCD1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms