Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBA3Q8TBC4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA3Q8TBC4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA3Q8TBC4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA3Q8TBC4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms