Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC148Q8NFR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC148Q8NFR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms