Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF248Q8NDW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF248Q8NDW4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF248Q8NDW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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