Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11CQ8NB49 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11CQ8NB49 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP11CQ8NB49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms