Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFSD2AQ8NA29 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms