Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLIP4Q8N3C7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CLIP4Q8N3C7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CLIP4Q8N3C7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLIP4Q8N3C7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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