Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D3Q8IZS8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA2D3Q8IZS8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms