Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLFN12Q8IYM2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12Q8IYM2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms