Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOT1Q8IXI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT1Q8IXI2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT1Q8IXI2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms