Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOT2Q8IXI1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOT2Q8IXI1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms