Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN4BQ8IWT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms