Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC50Q8IVM0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms