Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A9Q8IVB4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A9Q8IVB4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A9Q8IVB4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms