Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV53

DENND1C, DENN domain-containing protein 1C, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1CQ8IV53 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DENND1CQ8IV53 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENND1CQ8IV53 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENND1CQ8IV53 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms