Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPFIBP1Q86W92 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIBP1Q86W92 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms