Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms