Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM135Q86UB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM135Q86UB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms