Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF3Q7Z739 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms