Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLASP1Q7Z460 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
CLASP1Q7Z460 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms