Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATG9AQ7Z3C6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATG9AQ7Z3C6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms