Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC29A4Q7RTT9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms