Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OTOP2Q7RTS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP2Q7RTS6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms