Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMUB2Q71RG4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMUB2Q71RG4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms