Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC73Q6ZRK6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.5 ms