Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUFY4Q6ZNE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUFY4Q6ZNE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms