Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCD1Q6ZMY3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms