Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPTE2Q6XPS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPTE2Q6XPS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms