Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO3Q6UWJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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