Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms