Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPESP1Q6UW49 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPESP1Q6UW49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms