Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC171Q6TFL3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms