Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms