Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE2Q6PIF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCE2Q6PIF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms