Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C22orf39Q6P5X5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C22orf39Q6P5X5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms