Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEK5Q6P3R8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK5Q6P3R8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms