Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LLGL2Q6P1M3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LLGL2Q6P1M3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms