Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms