Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms