Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRR27Q6MZM9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRR27Q6MZM9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms