Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms